アクション
近接攻撃と遠隔攻撃
エバンたちはそれぞれ、近接武器（剣など）と遠隔武器（銃や弓など）で敵を攻撃できます。
近接攻撃は2種類あり、[X]ボタンで威力は小さいが隙が少ない弱攻撃、[Y]ボタンで隙が大きいが威力も大きい強攻撃を放つことができます。
また、遠くの敵を攻撃するときは、RBで遠隔攻撃をしましょう（MPを消費します）。RBを押し続けてから離すと、「チャージ射撃」となり威力が上がります。
ガードと回避
LBを押し続けている間は「ガード状態」となり、すばやく動けなくなる代わりに、敵の攻撃から受けるダメージを減らすことができます。また、移動しながらLBを押すと、前転などの「回避行動」を行い、敵の攻撃を避けることができます。
ロックオン
右スティック ボタンを押すと、近くの敵にターゲットマーカーがつき、相手をロックオンします。ロックオンした敵は、常に視界に収め続けることができます。
ロックオン中に方向パッド左右を押すと、対象を近くの敵に切り替えられます。また、右スティック ボタンを押すとロックオンを解除できます。
スキルの発動
右トリガーを引いている間、画面右下にスキルパレットが表示されます。
[A]ボタン、[B]ボタン、[Y]ボタン、[X]ボタンを押すと、MPを消費して、各ボタンにセットされたスキル（特技や魔法）を発動します。
フニャ吸収とスキルの強化
スキルによっては、発動する際にボタンを長押しすると、近くのフニャを吸収することができます。対応するフニャを吸収することで、威力が上がったり、スキルそのものの性能がアップするものもあります。
フニャ号令
バトル中、フニャたちは敵を攻撃したり、スキルを使ったりして、エバンたちをサポートしてくれます。また、フニャたちの周囲に青いサークルが現れたとき、サークルの内側で[B]ボタンを押すと、さまざまな効果の「号令スキル」を発動できます。
アイテムを使う
バトル中にSTARTボタンを押すと、バトルを一時停止して、アイテムメニューが表示されます。この画面では、HPを回復したり、状態異常を治すアイテムを使用できます。
逃走する
バトルエリア（戦場）の端で、エリア外に向かって走り続けると、キャラクターの頭上に逃走ゲージが表示されます。これが満タンになると、敵から逃げることができます。
※途中で敵の攻撃を受けるとゲージが減ります。また、端から離れるとゲージは空に戻ります。
